Вы здесь

Вопросы преподавателю

91 сообщение / 0 новое
Последнее сообщение
Аватар пользователя Maximus
Maximus
Не в сети

начал изучать курс, чтобы хоть как-то разбираться в описаниях и результатах многочисленных генетических тестов, которые можно купить и по которым предлагают отследить генеалогию (по материнской/отцовской линии и т.п. и т.д.). но в итоге заинтересовался.

1. в частности, интересно стало подробней почитать на тему факторов транскрипции - зачем транскрипцию надо ускорять или замедлять? для меня как технаря это кажется сменой состояния, лишним усложнением, фактором ненедежности системы, что может привести к ошибкам. думаю, тут много неизученного.

2. еще интересно про вычислительные подходы к исследованию генкода (с точки зрения компьютерного хакера какие возможности/подходы изучения кода доступны), про появившиеся генетические онлайн-лаборатории (где-то читал, что можно состряпать светящееся растение, и тебе пришлют его сконструированный посадочный материал).

3. возвращаясь к тестам интересно узнать - а есть ли вменяемые базы результатов гентестов для целей генеалогии. хочу узнать я из африки или азии или с луны свалился))). что еще можно узнать из баз?

вопросы 2 и 3 конечно больше прикладные и возможно поэтому не в тему, но буду рад проверенным и надежным напутствиям/ссылкам.

Аватар пользователя Юшкова Анна Александровна
Юшкова Анна Але...
Преподаватель
Не в сети

1. Транскрипцию надо ускорять/замедлять по состоянию клетки (организма). Например, есть гормональный сигнал → клетка быстрее синтезирует определенные белки (и наоборот). Сложнее. Но позволяет более тонко регулировать состояние - дает больше преимуществ.

2. Именно генетический код - изучен, т.е. установлено какие триплеты отвечают за какие аминокислоты. Методы, кстати, были, в первую очередь, биохимические. А вот разобраться во всей-всей-всей последовательности нуклеотидов ДНК человека (и других организмов - ведь уже многие известны (секвенированы) полностью) - очень непростая задача. Многое в этой последовательности понятно - но и многое еще без ответа.

И еще точка приложения усилий математиков/программистов/биологов - создание программ (алгоритмов), которые позволяют результаты считывания небольших последовательностей ДНК (кусочков хромосомы) "превратить" в единую последовательность ДНК одной целой хромосомы.

3. Про базы - наверняка есть. Идут ведь и сравнительные исследования митохондриальной ДНК (генеалогия по женской линии), и Y-хромосомы; но куда именно обратиться "с практической целью" не подскажу - просто не знаю. Надо искать :)

Аватар пользователя Мария
Мария
Не в сети
Факторы транскрипции (лекция 1.3)
Добрый день!

Приведу расшифровку части лекции "Скорость транскрипции у ядерных организмов зависит от работы разнообразных факторов транскрипции. Одни из них ускоряют процессы, другие замедляют. Участки ДНК, которые отвечают за более быструю работы РНК-полимеразы, которые обеспечивают возможность этой более быстрой работы, называются энхансерами". Во время этих слов надпись на экране "Энхансеры - участки ДНК, ускоряющие процесс после соединения с факторами транскрипции".

Неясно, так что такое фактор транскрипции? Если судить по речи, это участки ДНК (энхансеры и сайленсеры). Если по надписи на экране, то это что-то иное и с этим чем-то соединяются энхансеры.

И что значит - участки ДНК? Совокупность генов, триплетов, нуклеотидов?

Спасибо!

Мария

Аватар пользователя Юшкова Анна Александровна
Юшкова Анна Але...
Преподаватель
Не в сети

Участки ДНК - это именно последовательность нуклеотидов ("от точки А до точки В").

Факторы транскрипции - определенные вещества (белки, регуляторные РНК, ...). Но эти вещества осуществляют свою функцию только присоединившись к ДНК. Присоединение - в определенных местах/участках (эти места/участки носят имена энхансеров, сайленсеров и др.).

Аватар пользователя Ученый
Ученый
Не в сети

Объясните пожалуйста, в чем суть свойства помехоустойчивости генетического кода еще раз...я не поняла

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

В целом, помехоустойчивость подразумевает тот факт, что (в частности, в силу вырожденности) большинство точечных мутаций не приводит к потери функции белка, так как часть мутаций (как правило замена нуклеотида в третьей позиции триплета) не изменяет аминокислоту, часть заменяет аминокислоту,но не изменяет при этом её класс (полярность, заряд). 

А более подробно (с математическими выкладками) можете почитать здесь: http://scorcher.ru/theory_publisher/show_art.php?id=215

Аватар пользователя Екатерина
Екатерина
Не в сети

Здравствуйте! С праздником! Спасибо за чудесные лекции! К сожалению, один вопрос остался неясен, поэтому хотела бы уточнить: в ядре клетки человека находятся 46 хромосом, в каждой из которых находится часть молекулы днк, или в каждой хромосоме своя молекула днк, т.е. в ядре клетки 46 разных молекул днк? Эти куски молекул (молекулы?) никак не соединены между собой? Когда говорится "молекула днк", имеется в виду совокупность кусков(молекул)?

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

Каждая хромосома представляет собой отдельную молекулу ДНК, то есть в соматических клетках человека содержится по 46 молекул ДНК, которые находятся в ядре, но при этом не соединены между собой.

Под "молекулой ДНК" следует понимать именно одну молекулу, а если говорится просто "ДНК" клетки, то речь может идти о суммарной ДНК всех хромосом (и не только ядерных хромосом, но и о ДНК митохондрий и хлоропластов, в случае растений).

Аватар пользователя Екатерина
Екатерина
Не в сети

Спасибо большое! Теперь всё встало на свои места.

Аватар пользователя Abuela
Abuela
Не в сети

Спасибо за вопрос. Не решалась задать.

Аватар пользователя ПрофиТролль
ПрофиТролль
Не в сети

Урок 2.1 - 3:42 " Средняя частота мутаций у человека... на одну гамету за каждое поколение."

Что здесь подразумевается под "поколением"?

 
Аватар пользователя Svyataslava2
Svyataslava2
Не в сети

как классифицируется мутация произошедшая в результате внутренних причин(нарушений) в клетке(организме)?Если произошло нарушение в клутках и организме какую мутцию можно ожидать....вредную если это было воздействие вируса,а просто нарушения?

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

Мутации, произошедшие без намеренного воздействия мутагенами, называют спонтанными. То есть они происходят в результате повреждений в процессе жизнедеятельности. Это классификация по происхождению мутации.

А по поводу отнесения спонтанной мутации к вредным/нейтральным/полезным нельзя сказать однозначно. Для определения этого свойства необходимо учесть влияние мутации на жизнеспособность данного организма в данных условиях.

Аватар пользователя Sara
Sara
Не в сети

Доброе утро!

В модуле 2. Мутации, часть 4. говорится о закономерности: чем старше родители, тем выше вероятность рождения ребенка с синдромом Дауна.

Будьте добры, при  экстракорпоральном оплодотворении эта закономерность сохраняется или наоборот (это выход из этой ситуации)  ?

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

При ЭКО тоже существует вероятность рождения ребёнка с синдромом Дауна.

Для семей из "группы риска по возрасту родителей" имеет смысл (как в случае естественного, так и в случае экстракорпорального оплодотворения) проведение пренатальной диагностики, которая позволяет выявить хромосомные аномалии. При этом в случае ЭКО тестирование эмбриона возможно провести до имплантации, что является преимуществом. Правда, в статье за 2012 год (http://hsci.ru/news/preimplantatsionnaia-geneticheskaia-diagnostika-zash...) написано, что в России такая методика не развита. 

Аватар пользователя Abuela
Abuela
Не в сети

Хочу поблагодарить за интересные и познавательные лекции. Прошла тест по главе 3 успешно, с драконами вроде как справляюсь, а вот как мой кот получился с его серым окрасом не совсем понимаю. 

Задача: Кошка серого окраса с белой манишкой и белыми носочками родила три котенка. Два из них абсолютная копия матери: серые с белыми манишками, а третий кот ( самец) коричнево-черный без единого белого пятнышка. Какой у него отец был?  считается ли серый окрас доминантным в этом случае? 

Спасибо.

Аватар пользователя Юшкова Анна Александровна
Юшкова Анна Але...
Преподаватель
Не в сети

Если серый - это агути (а не какой-нибудь голубой-дымчатый), а черно-коричневый (?) видимо, черный, то ход рассуждений примерно такой:

т.к. котята  есть "агути с белыми пятнами" и "черный без пятен", то кошка с фенотипом "агути и белые пятна" гетерозигота по "агути" (Аа) и по пятнистости (Ss). У кошки наличие агути (А) маскирует локус "блэк", там, наверняка, прячется черный аллель - хотя 100 % утверждать нельзя - мог быть и от кота. Про кота однозначно сказать трудно, понятно только, что как минимум один рецессивный аллель в паре агути и в паре белых пятен у него был - т.к. есть котенок "не агути (черный), без пятен" - с рецессивными признаками.

Аватар пользователя Abuela
Abuela
Не в сети

Спасибо большое, Анна!

Когда с драконами справилась, решила порешать задачку о моем коте. И запуталась... Да, он не породистый, абсолютно чистый серый цвет с белыми носочками и манишкой. Как, интересно...И не знала, что он агути...Красивое слово:)  А третий котенок в помете, был редкого окраса. Поэтому и запомнился. Не черепаховый окрас ( ведь только кошки могут быть черепаховыми), а именно черный с темно-коричневым.

Получается агути-это не потомок черного и белого котов, а идет как чистая линия с доминантным геном " агути"? Еще раз уточню. 

 

Аватар пользователя Юшкова Анна Александровна
Юшкова Анна Але...
Преподаватель
Не в сети

А черный с коричневым как распределились? Полосками (или пятнами) или подшерсток коричневый, ость черная?

Чтобы понять агути-не агути посмотрите на отдельную серую волосинку: она в поперечную полосочку? Или все-таки равномерная? Если полосатая шерстинка, то агути. Если нет - тогда надо дальше подумать.

Аватар пользователя Okami
Okami
Не в сети

Я не химик, поэтому вопрос, может быть, немного глупый получится..)

Почему наследственная информация кодируется именно аминокислотами (белками)? Есть ведь еще множество других соединений.. Могло ли так получиться, например, что наследственная информация кодировалась какими-нибудь другими структурами (жирами? или чем-нибудь другим, более интересным).

Еще вопрос - а аминокислоты содержат все вещества из таблицы менделеева? или только их малую часть?

Аватар пользователя Okami
Okami
Не в сети

Я не химик, поэтому вопрос, может быть, немного глупый получится..)

Почему наследственная информация кодируется именно аминокислотами (белками)? Есть ведь еще множество других соединений.. Могло ли так получиться, например, что наследственная информация кодировалась бы какими-нибудь другими структурами (жирами? или чем-нибудь другим, более интересным)?

Еще вопрос - а аминокислоты содержат все вещества из таблицы менделеева? или только их малую часть?

 
Аватар пользователя Юшкова Анна Александровна
Юшкова Анна Але...
Преподаватель
Не в сети

Наследственная информация кодируется нуклеотидами. Но закодированы именно белки, строящиеся из аминокислот. Почему белки? Так они самые интересные и есть - их разнообразие существенно больше, чем у жиров и проч, соответственно, различия в структуре дают возможность различных функций.

В состав аминокислот входят 5 элементов: углерод, водород, кислород, азот и сера (в 2 шт).

Аватар пользователя Svyataslava2
Svyataslava2
Не в сети

3. узнается все по группе крови:
http://professiya-vrach.ru/article/gruppy-krovi-istoriya-proiskhozhdeniya/
http://streamlet.ru/articles/blood/17/
распределение групп крови по странам:https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%93%D1%80%D1%83%D0%BF%D0%BF%D0%B0_%D0%B...
2. метод секвенирования - http://postnauka.ru/longreads/468
трансгенные растения и прочие вопросы есть в доп литературе,Биологии 3 том Тейлор,можно взять новое издание 2004 года,там же трнскрипция

Аватар пользователя Svyataslava2
Svyataslava2
Не в сети

в доп материалах есть лекции
https://www.lektorium.tv/course/22955

Аватар пользователя Okami
Okami
Не в сети

Подскажите, говорит ли что-нибудь о генотипе (признака цвет глаз) тот факт, что при рождении у ребенка были голубые глаза? Потом они потемнели и стали карими. Можно ли это считать доказательством того, что в генотип гетерозиготен по цвету глаз (Аа)? или может быть и АА? (несмотря на то, что при рождении ребенка глаза были голубыми).

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

Цвет глаз при рождении у подавляющего большинства людей представляет собой оттенки голубого или серого, в редких случаях новорожденные имеют карие, тёмные глаза. Поэтому доказательством гетерозиготности цвет глаз при рождении быть не может.

Хотя существует корреляция между количеством меланина и цветом глаз ребёнка, не стоит забывать, что представление, используемое в задачах по генетике (один ген, два аллеля) в отношении наследования цвета глаз, сильно упрощено. На самом деле за формирование цвета глаз отвечает не только более двух аллелей одного гена, но и не один ген. Общая закономерность доминирования более тёмных оттенков при этом остаётся верной.

Аватар пользователя Okami
Okami
Не в сети

Подскажите, можно ли отследить признак "цвет кожи у людей" по такому же признаку, как цвет глаз? (то есть всего 2 признака гена: А - темная кожа, а - светлая).

У моих друзей-корейцев в разных поколениях встречается и более темная кожа, и более светлая (при этом и волосы, и глаза у всех всегда очень темные). Хотелось бы понять, как это наследуется. )

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

Цвет глаз, цвет волос, цвет кожи - всё это не качественные признаки, а количественные. Существует большое разнообразие оттенков, которые получаются в результате взаимодействий разных генов, отвечающих за эти признаки.

Относительно цвета кожи в задачах нередко используют приближение, в котором за цвет кожи отвечает два взаимодействующих гена (кумулятивная полимерия), что позволяет выделить 5 градаций цвета (от 0 до 4 доминантных аллелей).  

Аватар пользователя Юлия
Юлия
Не в сети

Добрый день! Раздел 4.2 "Комплиментарность" вопрос 3 для самопроверки: "Если у двух глухих родителей есть дети с нормальным слухом, то что можно утверждать о генотипах родителей?" правильным указан только вариант "ааВВ и ААбб"

Почему не: aa _ В   и   A_ bb?

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

Предлагаемые в тесте варианты ответа:

A_bb и aabb - нет B

aaB_ и aabb - нет А

AaBb и AaBb - родители не глухие

ааВВ и ААbb - верный ответ

Среди них нет варианта "aa _ В   и   A_ bb".

Аватар пользователя Юлия
Юлия
Не в сети

Раздел 4.6, задача 2 в разделе для самопроверки: "У кур ген окраски оперения сцеплен с полом, доминирует серебристая окраска, рецессивный вариант – золотистая. Каких производителей надо взять, чтобы пол цыплят различать по оперению?" Верный ответ помечен: золотистые петухи и серебристые курицы. Но в этом случае у меня получилась такая результат: ХаY (золот.петух) + ХАХ(А) (серебр.курица) :

ХАХа - серебр. курица

ХАХа - серебр. курица (значит, во втором аллеле у мамы надо ставить А, иначе получилась бы золот. цыпленок-самка)

ХАY - серебр. петух

ХАY - серебр. петух.

Где я ошиблась? (мне кажется, правильный ответ: золотистые куры + золотистые петухи).

 

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

При решении задачи Вы не учли, что у птиц пол определяется наоборот: гетерогаметным (XY) полом являются самки.

Аватар пользователя ПрофиТролль
ПрофиТролль
Не в сети

Есть следующий вопрос.

Мы говорим о комплементарности спиралей ДНК друг к другу, однако на уровле триплетов, ТАТ и АТА кодируют разные аминокислоты, А значит, каждая спираль коирует свои белки? Как же так. Получается, что только одна спираль кодирует белки, а другая служит для дополнения?

 
Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

Да, верно, для кодирования конкретного белка в рамках одного гена кодирующей последовательность аминокислот является одна цепь ДНК (в ней содержатся те самые триплеты, которым соответствуют аминокислоты белка), а вторая просто ей комплементарна (при этом именно она используется в качестве матрицы при транскрипции - чтобы получить мРНК, состоящую из необходимых триплетов). В то же время для другого гена на этой же хромосоме цепи могут поменяться местами и кодирующей может стать вторая цепь. 

Аватар пользователя Elf
Elf
Не в сети

Разве "генотерапия" и "генная терапия" не одно и тоже? В итоговом тесте ответ засчитан как неправильный.

Аватар пользователя A_Chekuryaev
A_Chekuryaev
Не в сети

Здравствуйте, Могли бы вы прокомментировать эту новость?

http://amoranta.com/news/53-sozdano-pervoe-iskusstvennoe-zhivoe-sushches...

Как сообщает журнал Science, ученым генетикам удалось «синтезировать» искусственное живое существо, которое оказалось полностью жизнеспособно. 

Причем изначально задачи оказаться в роли творца перед учёными не стояло. Они просто хотели «проверить», какое минимальное количество генов может содержать геном, необходимый для самостоятельного существования отдельного организма. Однако в результате была получена искусственная бактерия (она была названа JCVI-syn3.0), которой до сих пор не существовало в природе.

Взяв за основу бактерию Mycoplasma mycoides, чей геном состоит из 901 гена, ученые смогли вычленить из них только те, которые оказались реально необходимы для жизнедеятельности и размножения. В результате им удалось сократить число генов до 437, необходимых для самостоятельного существования нового организма и получить совершенно новую бактерию, не существующую в природе.

 

 

 

 

При этом им так и не удалось выяснить точное назначение трети генов, из которых состоит синтезированная бактерия, им только известно, что они необходимы для обеспечения жизнеспособности клетки.

Доктор Крейг Вентер, руководитель группы исследователей, уже сделал для Wall Street Journal заявление о том, что произведенный прорыв навсегда ставит крест на гипотезе о существовании особой «жизненной силы», отличающей живую материю от неживой.

«Теперь положен конец концепции, что существует нечто особое, способное вдохнуть жизнь, - заявил он. – наша работа предполагает, что жизнь можно низвести до молекулярной формулы».

«Теоретически мы можем добавлять наборы генов, менять этот геном и, в сущности, создавать любой организм», - пояснил доктор Вернер.

Аватар пользователя tagir
tagir
Не в сети

Интересно, а как в процессе дифференцировки клетки меняют свою специализацию? Меняется набор активных генов. А каким образом это происходит? И если возможно оставить одни гены активными, а другие пассивными, то возможен ли обратный процесс, когда мы к примеру из клеток одних тканей получаем недифференцированные клетки, которые в последствии сможем превратить, например, в клетки мозга.

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

Да, в процессе дифференцировки под действием разных факторов в клетках устанавливается набор активных генов, необходимых для выполнения их функций. 

Да, обратный процесс возможен! Но в пробирке. Начиная с 2006-го года в науке активно развивается направление индукции плюрипотентного состояния (соответствующего стволовым клеткам) в дифференцированных клетках. Для проведения данного процесса в клетках в чашках Петри активируют определённые гены, помещают эти клетки в соответствующую питательную среду и постепенно клетки приобретают свойства стволовых клеток, которые в природе существуют в эмбрионе, из которых может развиться клетка любой ткани организма. Впервые такой эксперимент был осуществлён профессором Яманакой, который в 2012 году получил Нобелевскую премию по физиологии и медицине за это открытие. Вновь изменив набор активных генов в таких индуцированных стволовых клетках можно получить клетки отличные от исходных. Этим сейчас занимается множество лабораторий. Создаются протоколы для эффективной дифференцировки в конкретных направлениях.

Ещё любопытные эксперименты, которые тоже сейчас проводятся, касаются процесса трансдифференцировки. При этом тоже из клеток одной ткани (например из клеток кожи) можно получить клетки другой ткани (например мозга), минуя стадию стволовых клеток. Такое тоже возможно, но при участии человека в искусственных условиях.   

Аватар пользователя Юлия
Юлия
Не в сети

Добрый день! Вопрос, может быть, немного не в тему, но. Как принято произносить по-русски названия генов? Простая транскрипция или еще как-то? Например, как русский генетик произнесет ген MC1R - "Эм-Си-один-Эр" или "Эм-Си-один-А" или "Эм-Си-уан-Ар"?

Аватар пользователя Анастасия Сорокина
Анастасия Сорокина
НГУ
Не в сети

Строгих правил произношения нет. Главное - это быть правильно понятым. Сейчас большинство научных текстов выходит на английском языке, поэтому англоязычное произношение тоже, как правило, понятно разбирающимся людям. В то же время для русскоговорящей аудитории цифры можно называть по-русски. Что касается произношения "R", то её чаще можно услышать как "эр".

Страницы